自治医科大学附属病院
  自治医科大学付属病院とは、各科の診療において協力体制を取っております。その中でも脳神経外科・整形外科・循環器内科・集中治療部・小児科には、同大学出身の医師が診療にあたっております。

獨協医科大学病院
独協医科大学付属病院とは特に、密接な医療連携を結んでおり、その中でも心血管肺内科・呼吸器アレルギー内科・内分泌代謝内科・神経内科・第二外科（消化器外科）・泌尿器科・小児科・眼科・救急医学講座（第二麻酔科）・皮膚科には、同大学出身の医師が診療にあたっております。

筑波大学付属病院
  筑波大学付属病院とは特に、放射線科・総合診療部及び睡眠時無呼吸症候群の診療において医療協力を行っております。

筑波メディカルセンター
  筑波メディカルセンターとは特に、心疾患・脳疾患などの緊急の対応を要する場合、３次救急病院としての協和中央病院とは常に緊密な医療連携が結ばれています。